张清，教授，广西大学高层次人才
邮箱：zhangqing970@126.com
研究方向： 1.甘蔗种质资源的精准评价
2.甘蔗蔗茎发育生物学研究
3.多倍体基因组学
个人简介：
广西大学农学院教授，博士生导师，亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室PI，广西高层次人才，广西八桂青年拔尖人才，博士后创新人才支持计划入选者，深圳市海外高层次人才（孔雀计划），中国农业科学院深圳农业基因组研究所博士后，已发表各类SCI论文45篇，其中以第一或通讯作者（含共同）在《Science》，《Nature Genetics》（2篇），《PNAS》，《Nature Communications》，《New Phytologist》，《Plant Journal》等杂志上发表论文14篇，总引用次数>3000次（Google Scholar统计），3篇入选Web of Science高被引论文，部分成果入选2022年中国植物科学领域重要研究进展，先后荣获福建省自然科学一等奖（4/5）、福建省第十三届自然科学优秀学术论文三等奖、福建省优秀博士学位论文等奖项，先后主持国家自然科学基金、广西科技重大专项、博士后创新人才支持计划项目、博士后面上基金、中国农业科学院“优农计划”重点项目、中德美-创新型人才国际合作项目等基金12项，申请发明专利2件，参与制定团体标准1项，共同选育甘蔗新品种1个，受邀担任广西热带作物学会理事，中文核心期刊《基因组学与应用生物学》编委，《甘蔗糖业》青年编委，《Tropical Plants》杂志专刊客座编辑, 多次担任《Molecular Horticulture》,《Communications Biology》,《Horticulture Research》, 《Molecular Genetics and Genomics》，《BMC Plant Biology》等10余种期刊的审稿人。
一、主持的科研项目
1）国家自然科学基金青年项目，2023/01-2025/12，30万元，主持，已结题。
2）广西科技重大专项，2024/10-2027/09， 410万元，主持，在研。
3）博士后创新人才支持计划，2022/10-2024/02，63万元，主持，已结题。
4）博士后基金面上项目，2022/01-2024/01，8万元，主持，已结题。
5）中国农业科学院优农计划重点项目，2022/01-2024/01，16万元，主持，已结题。
6）广西八桂青年拔尖人才项目，2025/01-2028/12，60万元，主持，在研。
7）亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室自主课题，2023/09-2025/09，50万元，已结题。
8）中德美-创新型人才国际合作项目，2018/04-2019/04，14万元，已结题。
9）亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室学术骨干培养项目，2023/09-2025/09，30万元，已结题。
10）广西青苗人才项目，2025/01-2029/12，30万元，主持，在研。
11）广西大学高层次人才项目，2024/02-2027/02，主持，在研。
12）优秀博士学位论文基金项目，2019/01-2021/03，20万，主持，在研。
二、主要科研成果
在甘蔗种质资源的演化与评价、糖分代谢和多倍体演化等方面取得了一定的成绩。作为主要执行人解析了首个甘蔗核心原始种基因组（Nature Genetics, 2018）和现代栽培种甘蔗基因组（Nature Communications, 2024），阐明了高糖、高生物量及抗逆性状的遗传基础；发现了甘蔗原始种中古复制的染色体对（5号和8号染色体）的断裂重组，阐明了其演化轨迹及NBS-LRR基因低表达的表观调控机制（New Phytologist, 2026），系统地揭示了甘蔗割手密种的起源、染色体核型演化和群体历史（Nature Genetics, 2022）；构建了甘蔗多尺度图谱泛基因组框架，挖掘了SaTB1、SaIRX10、SaBAK5等关键农艺性状相关基因（Science, 2026），揭示了糖分转运蛋白基因在甘蔗种间的功能分化，提出了糖分转运蛋白基因的工作模型（Plant Journal，2020）。这些成果为甘蔗种质资源的创新与利用奠定了重要的基础。
三、代表性论文：
1. Zhang Q#, Qi Y#, Pan H#, Tang H#, Wang G, Hua X, Wang Y, Lin L, Li Z, Li Y, Ma P, Dou M, Wang Y, Wang H, Zhang X, Yao W, Wang Y, Liu X, Wang M, Wang J, Deng Z, Yang Q, Chen B, Zhang M, Ming R, Zhang J*. (2022). Genomic insights into the recent chromosome reduction and polyploidization of autopolyploid sugarcane S. spontaneum. Nature Genetics. 54 (6):885- 896.（#共同第一作者，排第1）
2. Huang Y#, Zhang Y#, Zhang Q#, Zhuang G, Li C, Wang B, Gao R, Xu Y, Qi Y, Hua X, Shi H, Xu Q, Yao W, Liu X, Qi Y, Chen B, Zhang M, Ming R, Tang H*, Zhang J*. (2026). Multiscale pangenome graphs empower the genomic dissection of mixed-ploidy sugarcane species. Science. 391(6785): eadx1616.（#共同第一作者，排第3）
3. Zhang J#*, Zhang X#, Tang H#, Zhang Q#, Hua X, Ma X, Zhu F, et al., (2018). Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L. Nature Genetics. 50(11):1565-1573.(封面故事; #共同第一作者，排第4)
4. Chen D#, Zhang Q#, Tang W#, Huang Z#*, Wang G#, Wang Y, Shi J, Novikova P, Xu H, Lin L, et al., (2020). The evolutionary origin and domestication history of goldfish (Carassius auratus). PNAS .117(47):29775-29785.（#共同第一作者，排第2）
5. Bao Y#, Zhang Q#, Huang J#, Zhang S#, Yao W, Yu Z, Deng Z et al., (2024). A chromosomal-scale genome assembly of modern cultivated hybrid sugarcane provides insights into origination and evolution. Nature Communications,15(1):3041.（#共同第一作者，排第2）
6. Zhang Q#, Hua X#, Liu H#, Yuan Y, Shi Y, Wang Z, Ming R, Zhang J*. (2021), Evolutionary Expansion and Functional Divergence of Sugar Transporters in Saccharum (S. spontaneum and S. officinarum). The Plant Journal.105(4):884-906.（#共同第一作者，排第1）
7. Wang Y, Qi Y, Zhang Y, Wang B, Sun X, Ding H, Xu J, Zhang Q*, Zhang J*. (2026) Evolution of paleo-duplicated chromosome pairs with enrichment of NBS-LRR genes generated through ρ-WGD in Poaceae. New Phytologist. 249(6):3104-3119.（*共同通讯作者）
8. Chen Y, Wu C, Yu X, Yao Z, Zhu G, He Z, Xiao S, Huang Y, Xu Q, Zhang J, Zhang Q*, Feng X*. (2026). Spatiotemporal transcriptome dynamics elucidate sucrose accumulation in modern sugarcane, Industrial Crops and Products, 241, 2026, 122813.（*共同通讯作者）
9. Zhang Q, Hu W, Zhu F, Wang L, Yu Q, Ming R, and Zhang J*. (2016). Structure, phylogeny, allelic haplotypes and expression of sucrose transporter gene families in Saccharum. BMC Genomics. 17:1.（第一作者）
10. Zhang Q, Cai M, Yu X, Wang L, Guo C, Ming R, Zhang J*. (2017). Transcriptome dynamics of Camellia sinensis in response to continuous salinity and drought stress. Tree Genetics & Genomes. 13, 78.（第一作者）
四、获得的荣誉：
1）福建省自然科学一等奖（4/5）
2）广西高层次人才
3）广西八桂青年拔尖人才
4）博士后创新人才支持计划（博新计划）
5）深圳市海外高层次人才（孔雀计划）
6）福建省第十三届自然科学优秀学术论文三等奖
7）第十七届全国植物基因学大会优秀Poster奖
8) 福建省优秀博士学位论文
